Ruoan tai veden välityksellä tarttuvat loiset eivät lisäänny ruoassa. Niiden elintarvikkeissa olevat rakkulamuodot, kystat ja toukat tuhoutuvat useinmiten pakastuksessa (alle -20 celsiusasteessa). Loismatojen ja alkueläinten aiheuttamia ruokamyrkytyksiä on vaikea tunnistaa, koska tartunta voi olla oireeton tai taudilla on pitkä itämisaika.
Ruokamyrkytyksiä aiheuttavia loisia ovat muun muassa seuraavat:
• Cryptosporidium parvum -alkueläin
• Giardia duodenalis -alkueläin
• Toksoplasma gondii -alkueläin
• Leveä heisimato (Dibothriocephalus latus)
• Ekinokokki-heisimato
• Anisakis simplex -sukkulamato
• Trikinella-sukkulamato