Valtakunnalliset viranomaiset
Maa- ja metsätalousministeriö vastaa sivutuotteita koskevan lainsäädännön valmistelusta ja kansainvälisistä yhteyksistä.
Ruokavirasto ohjaa ja valvoo keskushallinnon viranomaisena sivutuotelainsäädännön täytäntöönpanoa ja noudattamista. Ruokavirastolla on myös toimeenpanotehtäviä ja se valvoo hyväksymiään ja rekisteröimiään sivutuotealan laitoksia.
Aluehallintovirastojen valvontaviranomaiset
Alehallintovirastot ohjaavat ja koordinoivat sivutuotevalvontaa alueellaan.
Kunnan valvontaviranomaiset
Kunnaneläinlääkärit valvovat hyväksymiään ja rekisteröimiään sivutuotealan laitoksia. Lisäksi he valvovat Ruokaviraston hyväksymiä ja rekisteröimiä laitoksia, jotka eivät sijaitse teurastamoiden yhteydessä. Kunnaneläinlääkärit valvovat myös toimialueellaan muita paikkoja, joissa sivutuotteita kerätään, käsitellään käytetään tai hävitetään.