Kimmo Kivivirta on aloittanut postdoc-tutkijana Ruokavirastossa osana valtion tutkimuslaitosten postdoc-ohjelmaa, jonka tavoitteena on vahvistaa tutkimus- ja kehittämisosaamista yhteiskunnan keskeisillä aloilla.
Kivivirran työ keskittyy eläintautivirologiaan ja erityisesti siihen, miten uusimmat sekvensointiteknologiat voidaan valjastaa diagnostiikan tueksi.
– Sekvensointiteknologiat ovat keskeisessä roolissa eläintautidiagnostiikassa, Kivivirta kertoo.
Ruokavirastossa käytössä ovat jo pitkään olleet Sanger- ja Illumina-pohjaiset menetelmät, jotka tarjoavat luotettavan perustan virusten tunnistamiseen ja analysointiin. Kivivirran käynnissä oleva projekti vie kehitystyötä askeleen pidemmälle. Tavoitteena on ottaa käyttöön nanopore-sekvensointiin perustuva MinION-sekvensaattori nykyisten teknologioiden rinnalle.
– Haluamme kehittää MinION-sekvensointiin soveltuvia menetelmiä juuri eläintautivirologian tarpeisiin. Näin pystymme laajentamaan ja nopeuttamaan diagnostiikan mahdollisuuksia, hän kuvaa.
Pelkkä laitteisto ei kuitenkaan riitä, sillä myös datan käsittely on keskeisessä roolissa. Siksi projektissa panostetaan vahvasti bioinformatiikkaan.
– Otamme käyttöön uusia työkaluja sekvenssidatan analysointiin. Tavoitteena on varmistaa, että pystymme hyödyntämään kasvavaa tietomäärää tehokkaasti myös tulevaisuudessa, Kivivirta kertoo.
Uudet teknologiat ja analyysimenetelmät avaavat mahdollisuuksia entistä tarkempaan ja nopeampaan eläintautien tunnistamiseen, ja sitä kautta parempaan varautumiseen.
Tervetuloa kuulemaan lisää Kimmo Kivivirran projektista "Veterinary Virology and Next-Generation Sequencing Technologies" tiistaina 2.6.2026.
#tulanetpostdoc
