Tuojan on huolehdittava, että tullille annettavassa tulli-ilmoituksessa (SAD-lomake) sekä laskuissa ja muissa kaupallisissa asiakirjoissa mainitaan selvästi, että kyseessä on luomutuotteiden tuonti. Tulli-ilmoituksen tavaran kuvaukseen on merkittävä esim. teksti "luomu". Tavaran koodi ei yksilöi tuotetta luonnonmukaisesti tuotetuksi.
Sähköisessä tullausilmoituksessa tulee käyttää luomutuotteille tarkoitettua asiakirjakoodia: (C644) .
Mikäli tuotteita ei ilmoiteta luonnonmukaisiksi, tulli käsittelee tuotteet tavanomaisina. Tuoja ei voi tullauksen jälkeen käsitellä tai markkinoida tavanomaisena tullattuja tuotteita luonnonmukaisina, vaikka tuojalla olisi jälkikäteen esittää Ruokaviraston myöntämä lupa ja lähetykseen liittyvä alkuperäinen tarkastussertifikaatti.
Lähetys on heti saavuttuaan EU:n rajatullitoimipaikkaan esitettävä tulliviranomaisille sellaisenaan ja alkuperäisin, vientimaassa tehdyin merkinnöin. Samassa yhteydessä on esitettävä myös alkuperäinen tarkastussertifikaatti ja tarvittaessa lupa tuoda luomutuotteita EU:n alueelle.