Årskontroll
En aktör som omfattas av ekologisk övervakning ska i enlighet med EU-lagstiftningen genomgå en kontroll av ekologisk produktion på plats en gång om året. Under kontrollen granskas aktörens ekologiska verksamhet, bland annat ekologiska produkter och anskaffning av dem, tillverkning, spårbarhet, förpackningspåskrifter och bokföring. Under kontrollen jämförs aktörens verksamhet och bokföring med kraven i lagstiftningen om ekologisk produktion. Inspektören kommer överens med aktören om tidpunkten för kontrollen. Kontrollen kan också utföras utan förhandsanmälan. Kontrollen är avgiftsbelagd.
Förnyad kontroll
Om det under en kontroll av ekologisk produktion har konstaterats brister i efterlevnaden av lagstiftningen om ekologisk produktion kan aktören behöva genomgå en förnyad kontroll. I samband med kontrollen får aktören skriftliga anvisningar om vilka saker som ska korrigeras. Aktörens korrigeringar granskas genom en förnyad kontroll. Inspektören kommer överens med aktören om tidpunkten för kontrollen. Kontrollen är avgiftsbelagd.
Extra kontroll
Utöver årskontrollen utförs extra kontroller av aktören, särskilt när det gäller en viss ekologisk verksamhet eller annan verksamhet som tillsynsmyndigheten övervakar. Inspektören kommer överens med aktören om tidpunkten för kontrollen. Kontrollen kan också utföras utan förhandsanmälan. Kontrollen är avgiftsfri.
Fortsatt kontroll hos myndigheten
Tillsynsmyndigheten kan vid behov fortsätta ekokontrollen vid myndigheten och begära tilläggsuppgifter om ärenden som borde ha kontrollerats under årskontrollen eller den förnyade kontrollen. Kontrollen är avgiftsbelagd.
Oanmäld kontroll
En del av de ekologiska kontrollerna utförs utan föregående anmälan. Då får aktören inte något förhandsmeddelande före den egentliga kontrolltiden. Inspektören kommer till aktören eller kontaktar aktören per telefon och meddelar att hen anländer till platsen vid en viss tidpunkt. Aktören kan inte vägra kontrollen.